Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Brd4Q9ESU6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Brd4Q9ESU6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Brd4Q9ESU6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms