Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hapln2Q9ESM3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hapln2Q9ESM3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms