Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms