Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slco1c1Q9ERB5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slco1c1Q9ERB5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slco1c1Q9ERB5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slco1c1Q9ERB5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slco1c1Q9ERB5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Slco1c1Q9ERB5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slco1c1Q9ERB5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slco1c1Q9ERB5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slco1c1Q9ERB5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slco1c1Q9ERB5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slco1c1Q9ERB5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco1c1Q9ERB5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms