Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dap3Q9ER88 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms