Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp3a44Q9EQW4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp3a44Q9EQW4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms