Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP82

Wdr4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr4Q9EP82 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr4Q9EP82 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr4Q9EP82 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms