Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rarres2Q9DD06 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rarres2Q9DD06 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms