Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1dQ9DC28 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1dQ9DC28 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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