Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Foxp4Q9DBY0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxp4Q9DBY0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms