Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tm9sf1Q9DBU0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf1Q9DBU0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms