Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc97Q9DBT3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms