Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp27a1Q9DBG1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp27a1Q9DBG1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms