Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med27Q9DB40 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms