Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actrt1Q9D9J3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actrt1Q9D9J3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms