Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Tbc1d20Q9D9I4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbc1d20Q9D9I4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms