Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlirpQ9D8T7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms