Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tvp23bQ9D8T4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tvp23bQ9D8T4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tvp23bQ9D8T4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tvp23bQ9D8T4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tvp23bQ9D8T4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tvp23bQ9D8T4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tvp23bQ9D8T4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tvp23bQ9D8T4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tvp23bQ9D8T4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tvp23bQ9D8T4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tvp23bQ9D8T4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tvp23bQ9D8T4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tvp23bQ9D8T4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tvp23bQ9D8T4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tvp23bQ9D8T4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tvp23bQ9D8T4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms