Protein–RNA interactions for Protein: Q9D880

Timm50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm50Q9D880 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timm50Q9D880 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timm50Q9D880 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms