Protein–RNA interactions for Protein: Q9D848

AY761184, CRS1C-3, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761184Q9D848 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AY761184Q9D848 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AY761184Q9D848 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AY761184Q9D848 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AY761184Q9D848 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms