Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc94Q9D6J3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc94Q9D6J3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms