Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfn4Q9D6I3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms