Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D5Q8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D5Q8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms