Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4933428M09RikQ9D3X3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms