Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tchhl1Q9D3P1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tchhl1Q9D3P1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms