Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X0

Ankrd39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39Q9D2X0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ankrd39Q9D2X0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ankrd39Q9D2X0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms