Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim42Q9D2H5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms