Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Batf3Q9D275 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms