Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SarnpQ9D1J3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SarnpQ9D1J3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms