Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snu13Q9D0T1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snu13Q9D0T1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms