Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lsm12Q9D0R8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms