Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed3Q9D0L1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed3Q9D0L1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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