Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3bQ9CZT8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms