Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZQ6

Raet1e, Retinoic acid early-inducible protein 1-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raet1eQ9CZQ6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raet1eQ9CZQ6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms