Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prelid3bQ9CYY7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms