Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrs1Q9CYH6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrs1Q9CYH6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rrs1Q9CYH6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rrs1Q9CYH6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rrs1Q9CYH6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrs1Q9CYH6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrs1Q9CYH6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrs1Q9CYH6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms