Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms