Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sgo1Q9CXH7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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