Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms