Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tdrd12Q9CWU0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tdrd12Q9CWU0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms