Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d3Q9CSV6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms