Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rprd1bQ9CSU0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms