Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc43Q9CR29 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms