Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg12Q9CQY1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg12Q9CQY1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms