Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gkn2Q9CQS6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkn2Q9CQS6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms