Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl35Q9CQL6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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