Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rwdd1Q9CQK7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rwdd1Q9CQK7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms