Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RTRAFQ9CQE8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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