Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap3bQ9CQE1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms