Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700129C05RikQ9CQ77 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms